一般人們認為ISO9000與HACCP是不同的，但實際上兩者有許多共同之處，共同點在于:
    ——均需要全體員工參與
    ——兩者均結構嚴謹，重點明確
    ——目的均是使消費者(用戶)信任

    不同點在于：
    ——HACCP是食品安全控制統;
    ——ISO9000是適用于所有工業整體質量控制體系
    ——ISO9000是企業質量保證體系；而HACCP源于企業內部對某一產品安全性控制要求的體系，HACCP其原理為危害預防，而非針對最終產品檢驗，一般被較大型食品企業采用，一般企業也采用相近的控制系統生產高品質產品。

    HACCP是用于分析和測定關鍵控制點的一項專門技術，它不是一個死板的體系，必需根據產品的生產加工及設備等因素相應制定。

    HACCP是一個動態的、詳細的體系，不是一個紙面上的東西。HACCP需要與其它質量管理措施及衛生規范的支持，如供應商質量保證，統計質量控制及良好實驗室操作規范等。這些均與ISO9000原理相連，使企業向全面質量管理方面發展。